HCC-nin aşkarlanmasında onun faydalılığını müəyyən etmək üçün biz HCC-nin məlum diaqnozu olan və ya xaric edilmiş (HCC olmayan) şəxslərdə HCCscreen analizini qiymətləndirdik. AFP/ABŞ-müsbət/şübhəli şəxslərdən 65 HCC hadisəsi və 70 qeyri-HCC hadisəsi əldə etdik. Bu HCC-müsbət və ya HCC-mənfi status dinamik CT/MRT görüntüləmə və histoloji təsdiqə əsaslanır.

Bu 135 hadisə təlim kohortu kimi istifadə edilib və HCCscreen nəticələri klinik diaqnozla müqayisə edilib. Təhlildə müxtəlif növ biomarkerləri birləşdirən klassifikator yaratmaq üçün biz əvvəlcə cfDNA mutasiyalarının müxtəlif növlərini hər bir gen və ya lokus üçün maraq bölgəsinə (ROI) daxil etdik (bax. Metodlar). ROI balı, ROI daxilində hər bir nöqtə mutasiyası üçün zərərli təsirlərin və tezliyin ölçülmüş cəmi idi.