برای تعیین کاربرد آن در تشخیص HCC، ما روش HCCscreen را در افرادی که تشخیص شناخته شده HCC دارند یا حذف شده اند (غیر HCC) ارزیابی کردیم. ما 65 مورد HCC و 70 مورد غیر HCC را از افراد مشکوک AFP/US-مثبت به دست آوردیم. این وضعیت HCC مثبت یا HCC منفی بر اساس تصویربرداری CT/MRI پویا و تایید بافت شناسی بود.

این 135 مورد به عنوان گروه آموزشی مورد استفاده قرار گرفت و نتایج غربالگری HCC با تشخیص بالینی مقایسه شد. برای ساختن یک طبقه‌بندی کننده که انواع مختلف نشانگرهای زیستی را در سنجش ادغام می‌کند، ابتدا انواع مختلف جهش‌های cfDNA را در یک امتیاز ناحیه مورد نظر (ROI) برای هر ژن یا مکان جمع‌بندی کردیم (به روش‌ها مراجعه کنید). امتیاز ROI یک مجموع وزنی از اثرات مخرب و فرکانس برای هر جهش نقطه در یک ROI بود.