Pentru a determina utilitatea acestuia în detectarea HCC, am evaluat testul HCCscreen la persoanele care au un diagnostic cunoscut de HCC sau au fost excluse (non-HCC). Am obținut 65 de cazuri de HCC și 70 de cazuri non-HCC de la indivizi AFP/US-pozitivi/suspectați. Această stare HCC-pozitivă sau HCC-negativă sa bazat pe imagistica dinamică CT/RMN și pe confirmarea histologică.

Aceste 135 de cazuri au fost utilizate ca cohortă de instruire, iar rezultatele HCCscreen au fost comparate cu diagnosticul clinic. Pentru a construi un clasificator care integrează diferite tipuri de biomarkeri în test, mai întâi am prăbușit diferitele tipuri de mutații cfDNA într-un scor de regiune de interes (ROI) pentru fiecare genă sau locus (vezi Metode). Scorul ROI a fost o sumă ponderată a efectelor dăunătoare și a frecvenței pentru fiecare mutație punctuală într-un ROI.