Aby sme určili jeho užitočnosť pri detekcii HCC, hodnotili sme test HCCscreen u jedincov, ktorí majú známu diagnózu HCC alebo boli vylúčení (non-HCC). Získali sme 65 prípadov HCC a 70 prípadov bez HCC od AFP/US-pozitívnych/podozrivých jedincov. Tento HCC-pozitívny alebo HCC-negatívny stav bol založený na dynamickom CT/MRI zobrazení a histologickom potvrdení.

Týchto 135 prípadov sa použilo ako tréningová kohorta a výsledky HCCscreen sa porovnali s klinickou diagnózou. Aby sme vytvorili klasifikátor integrujúci rôzne typy biomarkerov v teste, najprv sme zbalili rôzne typy mutácií cfDNA do skóre oblasti záujmu (ROI) pre každý gén alebo lokus (pozri Metódy). Skóre oblasti záujmu bolo váženým súčtom škodlivých účinkov a frekvencie pre každú bodovú mutáciu v rámci oblasti záujmu.